28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1616 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  35.58 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  39.57 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  31.91 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  33.14 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  30.34 
 
 		 465 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  32.95 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  30.65 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  32.7 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  31.43 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  34.06 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  31.13 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  32.12 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  30.99 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  40.91 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  29.28 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  35.34 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  27.91 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  29.32 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  28.57 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1761  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0144644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  30.23 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  24.46 
 
 		 484 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  33.71 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  33.02 
 
 		 309 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  29.41 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.8 
 
 		 383 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  24.31 
 
 		 190 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>