22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1336 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  25.25 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  23.76 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  27.09 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  24.61 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  24.89 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  22.91 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  27.36 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.16 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  21.9 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  21.29 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  23.38 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  25.26 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  24.86 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  23.24 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  24.06 
 
 		 473 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  23.76 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  23.76 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  23.71 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  23.6 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  23.66 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>