More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0677 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 396 aa  793    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  56.88 
 
 		 398 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  56.74 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  57.49 
 
 		 654 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  55.22 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  55.22 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  57.18 
 
 		 393 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  56.51 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  53.57 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  54.69 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  55.27 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  54.48 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  53.67 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  56.7 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  51.93 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  52.17 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.52 
 
 		 650 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 		 399 aa  418  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  53.05 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  53.33 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  52.56 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  53.2 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  52.58 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1551  Phosphoglycerate kinase  53.2 
 
 		 392 aa  411  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.15 
 
 		 646 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  52.67 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  52.67 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  52.94 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  52.9 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0879  Phosphoglycerate kinase  51.27 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.436803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  51.02 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  51.03 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  51.03 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  51.03 
 
 		 394 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  51.91 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1753  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.093261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  51.03 
 
 		 394 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  53.42 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  51.03 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 394 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  52.43 
 
 		 395 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  51.67 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  50.39 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  48.59 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 397 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  51.66 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  52.04 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  52.28 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  50.89 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 401 aa  388  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  48.33 
 
 		 395 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2806  phosphoglycerate kinase  52.05 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.19528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  48.33 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  49.61 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  47.21 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2851  Phosphoglycerate kinase  51.77 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5959  phosphoglycerate kinase  50.52 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0416  phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0663  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 		 397 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.318598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  48.97 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3250  phosphoglycerate kinase  51.77 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>