More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4123 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4123  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
329 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  35.99 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.13 
 
 
262 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.43 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  33.73 
 
 
261 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  31.93 
 
 
261 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  30.56 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  30.12 
 
 
262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  30.12 
 
 
262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  32.04 
 
 
262 aa  138  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.45 
 
 
265 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  33.23 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  29.82 
 
 
262 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.61 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  30.15 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0050  fagellar hook-basal body protein  31.3 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  31.74 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.73 
 
 
266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.41 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.41 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1689  flagellar basal body rod protein FlgG  30.56 
 
 
262 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.1 
 
 
260 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.22 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.67 
 
 
260 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2923  flagellar basal-body rod FlgG  29.82 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  28.53 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  29.41 
 
 
260 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.34 
 
 
266 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  31.74 
 
 
275 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2960  flagellar basal body rod protein FlgG  28.92 
 
 
261 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3252  flagellar basal body rod protein FlgG  28.83 
 
 
261 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.82 
 
 
261 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.97 
 
 
261 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1097  flagellar basal body rod protein FlgG  29.63 
 
 
262 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  29.52 
 
 
261 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.52 
 
 
261 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2605  flagellar basal body rod protein FlgG  29.82 
 
 
261 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.772523  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  29.09 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  29.09 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  29.82 
 
 
262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.55 
 
 
270 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  30.15 
 
 
264 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1431  flagellar basal body rod protein FlgG  29.82 
 
 
262 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.67 
 
 
263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  30.52 
 
 
310 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  28.31 
 
 
262 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  42.77 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  28 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  30.06 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  29.47 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  29.02 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.27 
 
 
263 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  29.02 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  29.7 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  29.22 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  28.31 
 
 
261 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  28.4 
 
 
260 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  28.4 
 
 
260 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  28.4 
 
 
260 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  28.4 
 
 
260 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  28.4 
 
 
260 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  28.71 
 
 
260 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.71 
 
 
260 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  28.71 
 
 
260 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  28.71 
 
 
260 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.88 
 
 
262 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  28.71 
 
 
260 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  28.71 
 
 
260 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.95 
 
 
262 aa  116  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  31.46 
 
 
282 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0740  flagellar basal-body rod protein  29.85 
 
 
263 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2703  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.63 
 
 
266 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.64 
 
 
276 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  28.31 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  30.72 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0242  flagellar basal body rod protein FlgG  28.05 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0189  flagellar basal body rod protein FlgG  28.05 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  28.01 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4193  flagellar basal body rod protein FlgG  28.01 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  29.82 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2987  flagellar basal body rod protein FlgG  28.31 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  39.49 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.22 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.22 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.77 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2333  flagellar basal body rod protein FlgG  27.83 
 
 
262 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.22 
 
 
262 aa  113  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.99 
 
 
263 aa  113  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2115  flagellar basal body rod protein FlgG  28.61 
 
 
261 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.22 
 
 
260 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.76 
 
 
415 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2264  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.57 
 
 
262 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.03 
 
 
261 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  38.22 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  38.86 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1602  flagellar basal body rod protein FlgG  28.26 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  29.32 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  41.56 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  27.58 
 
 
260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>