More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3868 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3868  histidine kinase  100 
 
 		 454 aa  923    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0154  sensor histidine kinase/response regulator  34.96 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.313173 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05750  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1940  histidine kinase  33.26 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208818  normal  0.0947013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.905736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0907  sensor histidine kinase  22.65 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0644  histidine kinase  26.04 
 
 		 430 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00287376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  21.49 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4169  sensor histidine kinase  22.04 
 
 		 580 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1022  histidine kinase  22.57 
 
 		 580 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1172  sensor histidine kinase  22.04 
 
 		 580 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0874083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1274  sensor histidine kinase  21.24 
 
 		 580 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1217  sensor histidine kinase  21 
 
 		 580 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1016  sensor histidine kinase  20.76 
 
 		 580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.853387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1039  sensor histidine kinase  20.62 
 
 		 580 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1118  sensor histidine kinase  20.62 
 
 		 580 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1197  sensor histidine kinase  20.53 
 
 		 580 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.970095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1017  sensor histidine kinase  20.14 
 
 		 580 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1402  sensor histidine kinase  23.51 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00361795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  30.6 
 
 		 555 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  31.67 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  27.9 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  28.47 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02220  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  30.9 
 
 		 483 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  30.9 
 
 		 483 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  30.9 
 
 		 483 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  31.42 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  22.57 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  30.91 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 583 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  22.57 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  22.57 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  22.57 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8287  histidine kinase  32.51 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  22.57 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  22.81 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  30.04 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  22.81 
 
 		 466 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  23.93 
 
 		 466 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 433 aa  99.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  30.96 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3087  histidine kinase  30.7 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0770082  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  22.26 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  30.96 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  25.48 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 597 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2867  histidine kinase  30.19 
 
 		 305 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  22.26 
 
 		 466 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  30.96 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  30.96 
 
 		 431 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  28.4 
 
 		 341 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  30.96 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  25 
 
 		 465 aa  97.8  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  30.67 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  30.23 
 
 		 474 aa  97.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 655 aa  97.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  30.67 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.12 
 
 		 512 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  29.11 
 
 		 451 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 585 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  28.81 
 
 		 593 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  30.54 
 
 		 431 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.98 
 
 		 459 aa  97.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  30.96 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 431 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  30.96 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  25.72 
 
 		 471 aa  96.7  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1253  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 584 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 643 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 637 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 590 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  28.63 
 
 		 1071 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 613 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  30.25 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 810 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  28.63 
 
 		 1071 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  30.25 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  29.83 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  27.64 
 
 		 648 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1926  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 697 aa  94.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  28.44 
 
 		 498 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 488 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 1127 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 459 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  26.09 
 
 		 1128 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 482 aa  94.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  28.99 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>