60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2052 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  100 
 
 		 689 aa  1368    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  36.5 
 
 		 658 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  36.19 
 
 		 668 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  27.02 
 
 		 623 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.05 
 
 		 637 aa  150  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  25.21 
 
 		 658 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  32.93 
 
 		 625 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  24.31 
 
 		 604 aa  116  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  22.57 
 
 		 646 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  24.55 
 
 		 653 aa  110  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  25.54 
 
 		 676 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.46 
 
 		 615 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.55 
 
 		 674 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.78 
 
 		 615 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  24.01 
 
 		 674 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  22.75 
 
 		 644 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.31 
 
 		 726 aa  95.9  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.15 
 
 		 622 aa  94.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  26.02 
 
 		 655 aa  94.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.23 
 
 		 749 aa  94  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1830  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.07 
 
 		 590 aa  90.1  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.51 
 
 		 619 aa  87.8  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.39 
 
 		 659 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.56 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  24.02 
 
 		 689 aa  84  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  23.88 
 
 		 680 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  22.72 
 
 		 686 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.92 
 
 		 746 aa  78.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  22.77 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  22.22 
 
 		 686 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  28.97 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.53 
 
 		 628 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.95 
 
 		 651 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  27.13 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.32 
 
 		 643 aa  73.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.97 
 
 		 757 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  33.33 
 
 		 638 aa  71.6  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  25.54 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.37 
 
 		 733 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.12 
 
 		 618 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.23 
 
 		 699 aa  64.3  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  24.42 
 
 		 649 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  23.43 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  21.19 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.5 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  27.27 
 
 		 657 aa  57  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.44 
 
 		 695 aa  57  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.54 
 
 		 632 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  20.45 
 
 		 849 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  23.08 
 
 		 705 aa  56.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  20.45 
 
 		 818 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.27 
 
 		 643 aa  54.7  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  20.3 
 
 		 852 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  21.79 
 
 		 842 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  24.69 
 
 		 782 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.23 
 
 		 835 aa  48.5  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  24.03 
 
 		 947 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.96 
 
 		 943 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.39 
 
 		 592 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.44 
 
 		 592 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>