More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0404 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0404  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 331 aa  649    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2576  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.1 
 
 		 326 aa  489  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0652542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0881  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.25 
 
 		 329 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.67624  normal  0.7592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.78 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.14 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.86 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.18 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.5 
 
 		 337 aa  391  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.09 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.8 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.33 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.8 
 
 		 354 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 		 344 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.9 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.57 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.8 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.42 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.18 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 		 344 aa  381  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.13 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.22 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.95 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.9 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.37 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.25 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  59.94 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 334 aa  374  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.37 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.47 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0922  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0472532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.19 
 
 		 341 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.37 
 
 		 351 aa  371  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.15 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1745  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 322 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.430959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3205  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.95 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.47 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.42 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0989  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.11 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 333 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>