189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5665 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5665  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
289 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5158  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.59 
 
 
308 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3019  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.2 
 
 
300 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000114003  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.37 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.88 
 
 
301 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.23 
 
 
290 aa  148  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13223  putative lipd A biosynthesis related exported protein  28.52 
 
 
294 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.743798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0861  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.23 
 
 
291 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652365  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0299  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.28 
 
 
288 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0692003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.53 
 
 
305 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0949  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.9 
 
 
285 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  28.69 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2172  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.46 
 
 
293 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4503  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.14 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  26.34 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  26.54 
 
 
291 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.69 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.71 
 
 
301 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  25.63 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.72 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  26.1 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.61 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.24 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.31 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.76 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  24.35 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.42 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.1 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.7 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.18 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.19 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.05 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5603  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.897415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.04 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2295  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.44 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.64 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.64 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1962  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.91 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310079  decreased coverage  0.00642577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.32 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.85 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.72 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.9 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.7 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1103  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.19 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842223  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0990  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.88 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210235  unclonable  0.000000000756062 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.74 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.39 
 
 
312 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0793  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.46 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.867069  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  18.46 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  21.77 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.86 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.75 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0661  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.2 
 
 
282 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0888578  hitchhiker  0.00380684 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.35 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.05 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.87 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.3 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.6 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.07 
 
 
284 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0769  lipid A biosynthesis acyltransferase  30 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2578  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.2 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074323 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.97 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  21.48 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0016  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.71 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.69 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1182  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.14 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.484152  hitchhiker  0.00223707 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.6 
 
 
293 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.18 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.1 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.97 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.71 
 
 
453 aa  55.8  0.0000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.5 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1693  lipid A biosynthesis acyltransferase  18.73 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.27 
 
 
288 aa  55.8  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0684  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.15 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.63 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.81 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0706  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.15 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0689551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.31 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1204  lipid A biosynthesis acyltransferase  18.87 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00305247  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3251  putative acyltransferase  23.28 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0077  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.85 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  19.56 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02288  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.17 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1279  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  23.17 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  20 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02249  hypothetical protein  23.17 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1291  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.17 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3609  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.17 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.426233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2514  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.17 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1097  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.59 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.92 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000374186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  20 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.92 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  21.76 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0350  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.85 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2746  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  23.17 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.92 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150874  hitchhiker  0.0000000000131974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>