More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4316 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1084  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.41 
 
 
281 aa  363  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19532 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1899  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.42 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.651881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.2 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0805  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40 
 
 
283 aa  195  7e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3859  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.64 
 
 
263 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0976  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.87 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3926  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.98 
 
 
263 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1079  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.91 
 
 
260 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06045  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.13 
 
 
277 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.56 
 
 
259 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3591  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.2 
 
 
259 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0647  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.2 
 
 
259 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0788  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.17 
 
 
258 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3658  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.2 
 
 
259 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3781  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.2 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.303771  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.22 
 
 
255 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.25 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.51 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2419  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.24 
 
 
374 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2041  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.58 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.833222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.63 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.45 
 
 
271 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3071  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.03 
 
 
298 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.36 
 
 
273 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.59 
 
 
271 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.4 
 
 
300 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.82 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0625  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.09 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.11 
 
 
264 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.99 
 
 
292 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.99 
 
 
292 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.58 
 
 
267 aa  131  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.55 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.31 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.03 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.23 
 
 
303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.57 
 
 
261 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.2 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.31 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0708  hypothetical protein  35.18 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.274354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.63 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.35 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.2 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.39 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.73 
 
 
310 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.21 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.86 
 
 
265 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.26 
 
 
285 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.3 
 
 
270 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.29 
 
 
270 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.95 
 
 
265 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.27 
 
 
262 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.3 
 
 
270 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.23 
 
 
261 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.16 
 
 
290 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.94 
 
 
262 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.95 
 
 
280 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.62 
 
 
296 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.5 
 
 
271 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.97 
 
 
267 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.82 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.55 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.16 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.06 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.84 
 
 
291 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.86 
 
 
274 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.625021  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.41 
 
 
272 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.75 
 
 
261 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.37 
 
 
268 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3365  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.87 
 
 
269 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.164199  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.2 
 
 
280 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.88 
 
 
296 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.5 
 
 
256 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.75 
 
 
261 aa  118  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.93 
 
 
301 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.21 
 
 
296 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.12 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_002620  TC0523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.28 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0161876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.7 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.6 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.06 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.21 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.7 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.96 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.01 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.4 
 
 
291 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.63 
 
 
268 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.85 
 
 
296 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>