More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3071 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3071  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
298 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
257 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.44 
 
 
257 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.06 
 
 
260 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.73 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.09 
 
 
266 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.43 
 
 
269 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.15 
 
 
260 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.92 
 
 
261 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.57 
 
 
262 aa  228  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.93 
 
 
265 aa  228  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.36 
 
 
268 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.39 
 
 
261 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.92 
 
 
261 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.36 
 
 
268 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.38 
 
 
267 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.63 
 
 
248 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.8 
 
 
266 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.8 
 
 
270 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.44 
 
 
263 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.68 
 
 
270 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.93 
 
 
268 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.12 
 
 
266 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.64 
 
 
269 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.81 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.55 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.01 
 
 
261 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.54 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.78 
 
 
271 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.9 
 
 
269 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.09 
 
 
274 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.9 
 
 
269 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.07 
 
 
290 aa  218  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.66 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
269 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
269 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.32 
 
 
271 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.32 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.84 
 
 
281 aa  216  4e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
268 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.06 
 
 
270 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.54 
 
 
273 aa  215  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.34 
 
 
271 aa  215  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.15 
 
 
268 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.15 
 
 
268 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.15 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.77 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.32 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.35 
 
 
265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.15 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.79 
 
 
267 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.48 
 
 
262 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.15 
 
 
280 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.7 
 
 
285 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.13 
 
 
256 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.44 
 
 
291 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.7 
 
 
286 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.45 
 
 
289 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.04 
 
 
288 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.77 
 
 
275 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.18 
 
 
271 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.38 
 
 
256 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.57 
 
 
287 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0992  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.21 
 
 
271 aa  206  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.8 
 
 
276 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
267 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.76 
 
 
269 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.06 
 
 
272 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.12 
 
 
296 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
280 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.79 
 
 
291 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.11 
 
 
281 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.41 
 
 
284 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.77 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2186  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1844  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.68 
 
 
280 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.3 
 
 
276 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0661  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.18 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.47 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.55 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.76 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.625021  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.55 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.79 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.49 
 
 
264 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.52 
 
 
282 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.75 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.39 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.39 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.39 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.86 
 
 
296 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.86 
 
 
282 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0795  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.16 
 
 
285 aa  192  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.42 
 
 
289 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.91 
 
 
263 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0625  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.76 
 
 
261 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.54 
 
 
285 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.06 
 
 
300 aa  191  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39 
 
 
291 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.66 
 
 
296 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>