125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3019 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3019  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
300 aa  618  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000114003  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5158  lipid A biosynthesis acyltransferase  62.35 
 
 
308 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5665  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.2 
 
 
289 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.46 
 
 
301 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.78 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  29.59 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0861  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.48 
 
 
291 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652365  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.59 
 
 
290 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13223  putative lipd A biosynthesis related exported protein  29.78 
 
 
294 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.743798  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2172  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.94 
 
 
293 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0299  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.09 
 
 
288 aa  109  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0692003  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  29.11 
 
 
296 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4503  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.37 
 
 
291 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0949  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.57 
 
 
285 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  29.82 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.27 
 
 
301 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.01 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  24.71 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.78 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.57 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.44 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.83 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.39 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  22.48 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.52 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.29 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.01 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  20.31 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.22 
 
 
324 aa  59.3  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.24 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.55 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.44 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.61 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.48 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  27.55 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.18 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001825  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.15 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000174296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.52 
 
 
325 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.22 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  20.91 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00650  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.35 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0031  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.65 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  22.66 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  22.39 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.68 
 
 
453 aa  53.9  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2522  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.8 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2592  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.57 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00440873  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.46 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.04 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.61 
 
 
326 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.83 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.04 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  22.86 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.46 
 
 
295 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.13 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.182003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  23.2 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.56 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.03 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4843  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.27 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391974  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.48 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.12 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.71 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.41 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0962  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.92 
 
 
334 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.19 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  19.83 
 
 
278 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  24.7 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  18.87 
 
 
306 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.26 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000374186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.13 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.83 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.26 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0990  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.47 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210235  unclonable  0.000000000756062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.63 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150874  hitchhiker  0.0000000000131974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.14 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.52 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02288  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  21.74 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1279  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  21.74 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2106  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.1 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2578  lipid A biosynthesis acyltransferase  23 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074323 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2514  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  21.74 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1291  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  21.74 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2746  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  21.74 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.53 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.14 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3609  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  21.74 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.426233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.3 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02249  hypothetical protein  21.74 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1520  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.48 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.52 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.03 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.66 
 
 
293 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.62 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2666  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  22.76 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2121  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  21.89 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.27 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0016  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.92 
 
 
295 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.54 
 
 
304 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.9 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>