38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2551 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 319 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  38.11 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.83 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.3 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.32 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.39 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.98 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  29.46 
 
 		 402 aa  57  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.69 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  36.76 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 530 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.3 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.8 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.63 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.4 
 
 		 193 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.83 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  31.4 
 
 		 193 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  29.73 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  25.42 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  34.67 
 
 		 394 aa  46.2  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2341  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  34.18 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2777  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.51 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00563136  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.88 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.05 
 
 		 212 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2731  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.03 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.05 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.23 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.23 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.69 
 
 		 242 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.23 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.23 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.23 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.29 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1462  CDP-diacylglycerol-phosphatidylglycerol phosphatidyltransferase  43.64 
 
 		 202 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.332491  normal  0.0171397 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1343  CDP-diacylglycerol-phosphatidylglycerol phosphatidyltransferase  34.09 
 
 		 207 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>