27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1550 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  100 
 
 		 122 aa  249  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  47.93 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  36.22 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  37.4 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  35.34 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  32.52 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  35.65 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  33.91 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  35.04 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  28.7 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  28.93 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  30.36 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  31.86 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  30.43 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  29.91 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  29.91 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  28.21 
 
 		 317 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  26.32 
 
 		 304 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 		 316 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  28.95 
 
 		 309 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  29.46 
 
 		 312 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  31.62 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  23.08 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  25.89 
 
 		 134 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  30.48 
 
 		 313 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  28.81 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  23.71 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>