More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1405 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  100 
 
 
507 aa  1038    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  63.04 
 
 
533 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  43.03 
 
 
565 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  43 
 
 
524 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.152473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  42.41 
 
 
543 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  39.52 
 
 
525 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  38.81 
 
 
528 aa  332  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  40.37 
 
 
546 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1584  carboxylesterase, type B  44.74 
 
 
522 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  37.85 
 
 
554 aa  312  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  40.92 
 
 
522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  38.9 
 
 
553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  37.05 
 
 
513 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  40.72 
 
 
547 aa  286  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  39.61 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  35.73 
 
 
553 aa  280  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  41.21 
 
 
569 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  35.71 
 
 
508 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  36.28 
 
 
524 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  35.24 
 
 
529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  36.58 
 
 
502 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  36.15 
 
 
502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  35.58 
 
 
506 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  36.15 
 
 
502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  36.15 
 
 
502 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  36.29 
 
 
502 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  36.06 
 
 
498 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07521  carboxylesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09230)  34.32 
 
 
560 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  36.51 
 
 
547 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  35.64 
 
 
531 aa  240  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1966  carboxylesterase, type B  34.53 
 
 
502 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2002  Carboxylesterase  34.74 
 
 
527 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  0.289287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5622  Carboxylesterase  33.79 
 
 
521 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3378  Carboxylesterase  33.78 
 
 
525 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  33.94 
 
 
507 aa  231  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2132  carboxylesterase type B  36.73 
 
 
501 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0594066  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  34.36 
 
 
501 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  33.01 
 
 
506 aa  226  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  32.28 
 
 
552 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  35.38 
 
 
537 aa  223  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  34.09 
 
 
535 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  34.09 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  34.09 
 
 
535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  33 
 
 
544 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  33.4 
 
 
501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  32.03 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  32.53 
 
 
529 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  33.54 
 
 
542 aa  213  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1015  Carboxylesterase type B  35.62 
 
 
474 aa  211  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4777  Carboxylesterase  34.62 
 
 
576 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2379  Carboxylesterase type B  31.49 
 
 
569 aa  209  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  32.16 
 
 
520 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0684  Carboxylesterase type B  33.78 
 
 
574 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  32.86 
 
 
490 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0247  Acetylcholinesterase  31.62 
 
 
517 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  32.43 
 
 
477 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  32.74 
 
 
540 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1297  Carboxylesterase type B  32.68 
 
 
571 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  33.4 
 
 
503 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  41.32 
 
 
507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3376  Carboxylesterase type B  34.25 
 
 
562 aa  200  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  32.51 
 
 
517 aa  200  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  33.47 
 
 
502 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  31.38 
 
 
497 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  32.2 
 
 
532 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  31.54 
 
 
503 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  32.64 
 
 
508 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  32.13 
 
 
551 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  33.27 
 
 
523 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  33.27 
 
 
523 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  33.27 
 
 
523 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3599  Carboxylesterase type B  31.27 
 
 
575 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  34.14 
 
 
501 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  31.27 
 
 
520 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  31.91 
 
 
551 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  31.4 
 
 
456 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4908  Acetylcholinesterase  29.94 
 
 
501 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511048  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  34.49 
 
 
496 aa  184  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  31.91 
 
 
518 aa  183  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4036  Carboxylesterase type B  30.2 
 
 
537 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  31.09 
 
 
519 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  29.86 
 
 
502 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  31.92 
 
 
553 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  29.53 
 
 
534 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  31.05 
 
 
496 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  30.4 
 
 
511 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5662  Carboxylesterase type B  38.54 
 
 
589 aa  178  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7204  carboxylesterase type B  30.21 
 
 
529 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  33.68 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  32.16 
 
 
528 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1944  Carboxylesterase  30.12 
 
 
553 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  0.353299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4535  Carboxylesterase  30.43 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512052 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  29.79 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  32.01 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  31.88 
 
 
497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  32.16 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0612  Carboxylesterase type B  31.25 
 
 
430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  31.94 
 
 
500 aa  173  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1863  carboxylesterase, type B  30.67 
 
 
569 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365563  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4595  Carboxylesterase type B  29.8 
 
 
550 aa  171  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>