41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1140 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  289  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  34.92 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  31.03 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  32.12 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  31.4 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  31.4 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  29.6 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  25.22 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  26.4 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  36.89 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  29.06 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  27.34 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  27.34 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  31.36 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  29.5 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  27.34 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  30.84 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  28.36 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  27.54 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  29.84 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  25.86 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  26.55 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  30.4 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3876  hypothetical protein  41.3 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  25.44 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  26.62 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  27.59 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  42.22 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  27.78 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  28.44 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  28.81 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  26.72 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  25.64 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  25.64 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  25.98 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6546  hypothetical protein  34.78 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>