170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0197 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0197  ApaG  100 
 
 		 128 aa  266  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190971  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0247  ApaG domain protein  71.88 
 
 		 128 aa  207  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2587  ApaG  68.75 
 
 		 128 aa  187  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0017  ApaG  59.38 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0222  ApaG  57.03 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  52.94 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1758  ApaG  41.41 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  46.46 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  49.19 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  49.19 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  46.4 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  49.17 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  46.83 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  46.09 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  48.28 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  45.6 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  49.19 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  48.28 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  44.8 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  44.8 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  45.97 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  44.63 
 
 		 211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  44 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  45.31 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  47.11 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  44 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  44.35 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  44 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12178  hypothetical protein  42.97 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  44.35 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  46.3 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0396  ApaG  46.34 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.352913  hitchhiker  0.000351729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  46.51 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  44 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  45.83 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  42.5 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  44.35 
 
 		 131 aa  106  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  44.35 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  44.35 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  45.83 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  44.8 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  46.77 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  41.94 
 
 		 237 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  41.94 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  45.97 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  46.55 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  42.02 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  45.3 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  44.35 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  45.38 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  45.69 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  43.1 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  42.02 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  42.02 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1874  ApaG  42.5 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.013678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  41.67 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  43.1 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  42.5 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  42.86 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  42.74 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  42.02 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  43.55 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  42.15 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  41.67 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  40.5 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  41.46 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  45.05 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  41.74 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  41.67 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  43.86 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1087  ApaG  48.36 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  41.46 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  41.46 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  44.07 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0921  ApaG  37.8 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.116399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  41.46 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  42.24 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0176  ApaG domain protein  42.74 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  42.5 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  40.5 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  44.14 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  41.67 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  41.67 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  40.5 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  42.11 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  40.65 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  39.34 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  39.67 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  44.86 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  40.65 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  45.08 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  40.83 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  40.65 
 
 		 126 aa  95.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  40.83 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  40.65 
 
 		 126 aa  95.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  40.65 
 
 		 126 aa  95.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  41.13 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  44.07 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  40.65 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  42.02 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>