170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0176 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0176  ApaG domain protein  100 
 
 
126 aa  255  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0406  ApaG domain-containing protein  58.06 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1993  ApaG  50.44 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000435659  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  47.66 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  47.66 
 
 
137 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  48.31 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  47.06 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  46.61 
 
 
130 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  45.76 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  47.83 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  48.72 
 
 
130 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  48.72 
 
 
130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  48.72 
 
 
130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  45.83 
 
 
185 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  46.67 
 
 
124 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  45.83 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  47.06 
 
 
126 aa  106  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  47.37 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  45.83 
 
 
124 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  45.83 
 
 
124 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  45.83 
 
 
147 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  46.96 
 
 
125 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  45 
 
 
124 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  45.83 
 
 
124 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  44 
 
 
144 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  45 
 
 
124 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  45 
 
 
124 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  45 
 
 
124 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  45 
 
 
124 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  45 
 
 
124 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  47.41 
 
 
130 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  45 
 
 
185 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  45 
 
 
124 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  45 
 
 
124 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  44.53 
 
 
124 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  46.85 
 
 
124 aa  103  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  42.4 
 
 
211 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  42.15 
 
 
127 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  44.07 
 
 
127 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  43.09 
 
 
130 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  45.3 
 
 
131 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  44.53 
 
 
124 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  44.53 
 
 
124 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  46.43 
 
 
127 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  44.17 
 
 
124 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  46.43 
 
 
127 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  44.8 
 
 
130 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  43.09 
 
 
140 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  43.9 
 
 
130 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  44.44 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  42.86 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  45.38 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  42.64 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  44.35 
 
 
136 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  43.33 
 
 
124 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  41.46 
 
 
131 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  43.48 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  45.3 
 
 
130 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  42.28 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  45.3 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  42.86 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  45.3 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0197  ApaG  42.74 
 
 
128 aa  98.2  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190971  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  41.74 
 
 
126 aa  97.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0396  ApaG  42.86 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.352913  hitchhiker  0.000351729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  42.37 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  44.35 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  40.83 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3900  ApaG domain-containing protein  44.44 
 
 
128 aa  96.7  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  45.69 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  44.35 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  41.53 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  39.17 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  44.35 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  41.74 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  40.8 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  44.86 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  48.25 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  41.03 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  41.6 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  43.97 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  42.24 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  41.13 
 
 
130 aa  94.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  40 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  43.97 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  42.74 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  43.09 
 
 
140 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  42.37 
 
 
126 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  42.74 
 
 
237 aa  93.6  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  42.24 
 
 
125 aa  94  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  43.97 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  43.44 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0247  ApaG domain protein  41.88 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  42.86 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  42.74 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  40.87 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  40.68 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  42.61 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  40.5 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  41.53 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>