170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0406 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0406  ApaG domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  270  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0176  ApaG domain protein  58.06 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  45.24 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  48.36 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  44.44 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  45.24 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  44.26 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  44.26 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  43.65 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  44.26 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1993  ApaG  47.37 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000435659  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  43.8 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  44.8 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  42.86 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  43.65 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  41.27 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  40 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  39.68 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  42.74 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  46.22 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  42.86 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  39.68 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  38.1 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  42.98 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  39.67 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0247  ApaG domain protein  43.33 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  42.06 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  38.1 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0197  ApaG  45 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190971  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  46.32 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  42.19 
 
 		 211 aa  94  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  45.69 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  38.76 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  40.87 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  44.74 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  39.68 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  42.5 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  39.67 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  44.74 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  42.37 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  41.74 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  42.61 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  40.8 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  42.37 
 
 		 157 aa  89.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  41.38 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  43.48 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  40.87 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  38.58 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  42.24 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  40 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  46.6 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  40 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  40 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  40 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  40 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  40 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  40 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  40 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12178  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  40.87 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  40.87 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  40 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  40 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  40 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  40 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  40 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  41.38 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  38.21 
 
 		 237 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  40.52 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  37.01 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  40.87 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  38.79 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  40 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  40.18 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  40.17 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  40.17 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  37.93 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00807  ApaG  38.46 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  37.7 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  38.66 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  38.58 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001666  ApaG protein  37.61 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  37.7 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2889  ApaG  38.52 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.203189  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  36.8 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  37.39 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  37.29 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  36.8 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  37.9 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  38.79 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  40 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  39.34 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  36.8 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  41.67 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  37.72 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0921  ApaG  41.03 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.116399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0396  ApaG  36.75 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.352913  hitchhiker  0.000351729 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>