More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0190 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 384 aa  786    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  48.23 
 
 		 388 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.12 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.34 
 
 		 393 aa  315  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.24 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.57 
 
 		 386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.61 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.08 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.9 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  44.73 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.99 
 
 		 398 aa  289  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.93 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.63 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  47.37 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.9 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.95 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.2 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  46.53 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.87 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.7 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  40.16 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.83 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  37.7 
 
 		 377 aa  256  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.94 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.75 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.75 
 
 		 380 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  37.88 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.9 
 
 		 392 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.55 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.44 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  40.18 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.46 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  35.14 
 
 		 373 aa  240  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.57 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.39 
 
 		 371 aa  229  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.58 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.78 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.81 
 
 		 391 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.34 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.89 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.36 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.04 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.53 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.02 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.33 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.67 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.07 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  33.24 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.02 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.76 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  32.36 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.54 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.79 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.94 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  29.25 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  33.82 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  31.7 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  30.22 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.86 
 
 		 375 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.38 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.51 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.5 
 
 		 358 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.4 
 
 		 408 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  30.84 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.26 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.29 
 
 		 377 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.72 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.19 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.95 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.3 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.06 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.79 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.54 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  31.3 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  29.53 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  28.62 
 
 		 408 aa  123  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.97 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.82 
 
 		 430 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.72 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.43 
 
 		 422 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  31.16 
 
 		 348 aa  113  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  31.16 
 
 		 348 aa  113  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.51 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  32.77 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.42 
 
 		 427 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  29.58 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  34.62 
 
 		 200 aa  96.3  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.37 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.07 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.41 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.55 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.93 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.72 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  26.39 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.13 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.98 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.73 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.64 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>