More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1958 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
401 aa  819    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3149  acetylornithine aminotransferase  66.67 
 
 
402 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.457305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0914  acetylornithine aminotransferase  61.62 
 
 
399 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  60.61 
 
 
405 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  58.33 
 
 
400 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  56.81 
 
 
397 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47.83 
 
 
402 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  49.74 
 
 
396 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.99 
 
 
396 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  43.67 
 
 
397 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  43.15 
 
 
397 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  42.6 
 
 
395 aa  354  1e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  45.9 
 
 
399 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  41.77 
 
 
396 aa  350  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  45.62 
 
 
399 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.75 
 
 
396 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  45.06 
 
 
399 aa  347  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  44.85 
 
 
400 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  41.56 
 
 
395 aa  346  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.26 
 
 
397 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  41.3 
 
 
395 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.42 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.97 
 
 
387 aa  335  9e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  42.63 
 
 
400 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
396 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  40.92 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.41 
 
 
394 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.92 
 
 
398 aa  322  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.76 
 
 
399 aa  322  9.000000000000001e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  40.26 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  43.56 
 
 
391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.81 
 
 
417 aa  318  9e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.89 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  42.27 
 
 
418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  39.64 
 
 
394 aa  311  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  43.84 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
380 aa  306  3e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 
390 aa  305  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.21 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.63 
 
 
409 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0591  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.84 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2847  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.84 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2785  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.84 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.21 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2425  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.84 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725646  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.12 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2866  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.84 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1736  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.84 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  40.51 
 
 
398 aa  302  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.68 
 
 
396 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  41.49 
 
 
388 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.86 
 
 
410 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  40.51 
 
 
398 aa  302  9e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2727  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.84 
 
 
410 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.96 
 
 
386 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.58 
 
 
411 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.89 
 
 
401 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  44.41 
 
 
391 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4291  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.34 
 
 
410 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.3 
 
 
388 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.33 
 
 
410 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 
388 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.63 
 
 
396 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  40.97 
 
 
398 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  43.01 
 
 
401 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1157  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.06 
 
 
410 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.0351204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  38.48 
 
 
423 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  39.48 
 
 
386 aa  296  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
427 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.89 
 
 
396 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  38.8 
 
 
386 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  39.69 
 
 
379 aa  294  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  38.54 
 
 
426 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  41.56 
 
 
403 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.3 
 
 
396 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.56 
 
 
398 aa  293  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  44.82 
 
 
394 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.62 
 
 
399 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.8 
 
 
410 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964628  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  42.16 
 
 
399 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  40.72 
 
 
398 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  43.09 
 
 
390 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  38.18 
 
 
386 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1558  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.28 
 
 
411 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.8 
 
 
410 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  40.72 
 
 
400 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.22 
 
 
412 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2923  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.28 
 
 
411 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.689777  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0690  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.72 
 
 
405 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.55 
 
 
446 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1957  acetylornithine aminotransferase  40.52 
 
 
399 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 
394 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  43.39 
 
 
401 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
398 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  43.85 
 
 
392 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  39.34 
 
 
422 aa  290  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
398 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>