34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0593 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  46.6 
 
 
256 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  42.36 
 
 
258 aa  169  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0767  hypothetical protein  27.57 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0749  hypothetical protein  27.1 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  29.33 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  26.95 
 
 
239 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  24.29 
 
 
236 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  25.66 
 
 
271 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  27.07 
 
 
215 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  23.79 
 
 
236 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  31.09 
 
 
265 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  28.89 
 
 
253 aa  56.6  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  27.46 
 
 
384 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  27.66 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  31.43 
 
 
386 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  25.36 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  26.98 
 
 
418 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  29.03 
 
 
265 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  24.62 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3314  hypothetical protein  29.92 
 
 
380 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0511788  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  28.46 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1074  hypothetical protein  37.5 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  28.23 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  26.67 
 
 
251 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1111  hypothetical protein  26.42 
 
 
268 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2663  hypothetical protein  27.32 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0705071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  22.4 
 
 
370 aa  46.2  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3509  hypothetical protein  27.56 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  26.24 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3184  hypothetical protein  30 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  27.87 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  24.62 
 
 
247 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  25.17 
 
 
247 aa  43.5  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>