More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0114 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  63.58 
 
 		 396 aa  407  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  51.99 
 
 		 304 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  45.54 
 
 		 409 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  45.82 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  45.12 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  46.36 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  46.49 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  47.51 
 
 		 309 aa  268  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  48.01 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  45.39 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  44.78 
 
 		 317 aa  266  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  44.85 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  47.04 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  47.02 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 308 aa  261  6.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  43.93 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  46.33 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  46.03 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  44.85 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  45.18 
 
 		 311 aa  258  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  45.18 
 
 		 311 aa  258  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  44.52 
 
 		 315 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  45.54 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  44.82 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  45.54 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  43.28 
 
 		 316 aa  255  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  44.19 
 
 		 318 aa  255  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  43.19 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  44.19 
 
 		 318 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  44.88 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  43.79 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  45.67 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  44.19 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.85 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.85 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  43.85 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  42.52 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  43.85 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  44.52 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  43.14 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.44 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  45.7 
 
 		 311 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  43.52 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  45 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  43.93 
 
 		 313 aa  247  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  43.33 
 
 		 311 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  46.2 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  40.4 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  42 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  48.18 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.75 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  45.13 
 
 		 311 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  41.81 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  42.52 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  43.28 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  44.33 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  43.79 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  43.52 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  43.05 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  41.53 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  43.67 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  43.67 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  43.67 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  45.9 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  43.38 
 
 		 310 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  43.05 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  45.16 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  43.67 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  42.57 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  43.83 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  41.06 
 
 		 330 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  44.55 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  43.64 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25220  thioredoxin-disulfide reductase  46.08 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000419952  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  45.1 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  41.2 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  41.39 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  43.89 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  41.53 
 
 		 348 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  42.53 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  44.48 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  38.74 
 
 		 339 aa  231  8.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  41.72 
 
 		 333 aa  231  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  41.12 
 
 		 359 aa  231  8.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  40.59 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  42.24 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.32 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  43.3 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  41.99 
 
 		 312 aa  229  6e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  41.12 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>