294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2663 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  100 
 
 
238 aa  480  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  55.65 
 
 
241 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  55.11 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  44.84 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1117  dethiobiotin synthase  43.05 
 
 
232 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  34.08 
 
 
263 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  36.32 
 
 
248 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  36.49 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  34.91 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  30 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  33.49 
 
 
244 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  32.39 
 
 
221 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 
210 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  31.11 
 
 
232 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  31.58 
 
 
242 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  35.41 
 
 
232 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  34.74 
 
 
474 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.84 
 
 
646 aa  101  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  39.77 
 
 
212 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  37.58 
 
 
217 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  31.33 
 
 
239 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  39.2 
 
 
212 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  39.04 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  30.7 
 
 
221 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  31.16 
 
 
221 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  40.91 
 
 
212 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  31.33 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  37.04 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  30.61 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  34.56 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  39.89 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  40.12 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  30.14 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  39.89 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  38.6 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  37.65 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  30.84 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  31.6 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  38.6 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  29.72 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  30 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  33.77 
 
 
244 aa  95.5  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  30.19 
 
 
242 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  36.57 
 
 
210 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  30.7 
 
 
243 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  34.63 
 
 
219 aa  95.1  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  32.73 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  30.92 
 
 
242 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  28.63 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  38.64 
 
 
212 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 
204 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  29.09 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  33.83 
 
 
215 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  33.7 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  28.51 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  34.78 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  29.17 
 
 
245 aa  92  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  29.25 
 
 
212 aa  92.4  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  37.84 
 
 
213 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  29.95 
 
 
242 aa  92  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  29.95 
 
 
242 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  29.61 
 
 
264 aa  91.7  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  30.58 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  30.58 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  29.63 
 
 
190 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  38.95 
 
 
202 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  28.64 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  38.29 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  37.63 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  30.48 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  29.09 
 
 
243 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  32.83 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  36.16 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  31.79 
 
 
212 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 
220 aa  89  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  42.62 
 
 
223 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 
206 aa  89  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  31.43 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  36.05 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  32.96 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  32.49 
 
 
212 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  41.53 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 
210 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  28.21 
 
 
186 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  36.36 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  36.69 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  34.81 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  32.39 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  31.1 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  36.47 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  41.53 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  29.6 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  26.5 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  35.05 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  33.96 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  33.54 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  31.78 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>