28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3013 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3013  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  333  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  55.83 
 
 
163 aa  189  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3395  hypothetical protein  48.5 
 
 
167 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0908  hypothetical protein  46.71 
 
 
167 aa  140  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  44.23 
 
 
169 aa  140  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  38.61 
 
 
189 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  38.61 
 
 
189 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3237  hypothetical protein  39.71 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.680138  normal  0.470977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3326  hypothetical protein  38.62 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0233532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3146  hypothetical protein  38.62 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3163  hypothetical protein  38.62 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228007  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3212  hypothetical protein  38.62 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3226  hypothetical protein  38.62 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0150572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2973  hypothetical protein  35.17 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237363  decreased coverage  0.00343665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3036  hypothetical protein  35.17 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0889  hypothetical protein  35.17 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3146  hypothetical protein  35.17 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2972  hypothetical protein  35.17 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0865  conserved hypothetical protein  35.17 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02674  hypothetical protein  35.17 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.164339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4091  hypothetical protein  35.17 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0320835  normal  0.410981 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02635  hypothetical protein  35.17 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3268  hypothetical protein  32.68 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0660732  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0679  type IV pilin  24.28 
 
 
181 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.639618  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3167  hypothetical protein  22.88 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  34.92 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  24.28 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  30.09 
 
 
177 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>