86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4235 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
257 aa  528  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  60.7 
 
 
255 aa  325  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  54.47 
 
 
293 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  57.87 
 
 
299 aa  294  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  51.92 
 
 
259 aa  279  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  52.34 
 
 
298 aa  278  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  49.23 
 
 
309 aa  271  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  49.81 
 
 
258 aa  267  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  51.17 
 
 
258 aa  265  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  51.18 
 
 
299 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  47.45 
 
 
304 aa  248  7e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  42.69 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  42.69 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  39.61 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  42.19 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  41.02 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  38.85 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
255 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  31.79 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  29.43 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  28.07 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  28.19 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  29.48 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  29.2 
 
 
262 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  28.06 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  25.45 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  27.35 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  26.91 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  26.14 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
332 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  24.44 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  26.69 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  25.51 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  23.75 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
352 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  26.4 
 
 
335 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  23.35 
 
 
201 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.07 
 
 
335 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  23.62 
 
 
243 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  25.42 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  25.15 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
353 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  21.69 
 
 
362 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  27.82 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  22.16 
 
 
376 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  24.45 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  25.25 
 
 
332 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  24.64 
 
 
365 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  25.1 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  29.32 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
353 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  21.88 
 
 
364 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
372 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  25.19 
 
 
303 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  24.43 
 
 
320 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  25.76 
 
 
332 aa  45.4  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  24.43 
 
 
320 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 
227 aa  45.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  26.32 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  25.91 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  22.1 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  23.28 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  22.92 
 
 
320 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  23.35 
 
 
358 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  26.78 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  23.3 
 
 
320 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  27.38 
 
 
361 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  23.3 
 
 
377 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  26.19 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.06 
 
 
368 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.82 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  22.02 
 
 
329 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  25.13 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  23.47 
 
 
234 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  23.55 
 
 
281 aa  42.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  20.63 
 
 
364 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
353 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  22.02 
 
 
342 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  22.02 
 
 
342 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  28.23 
 
 
371 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  23.92 
 
 
338 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  23.85 
 
 
360 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  21.88 
 
 
320 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.07 
 
 
325 aa  42  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>