23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4140 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 202 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  49.07 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  43.52 
 
 		 221 aa  174  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  40.38 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  38.97 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  39.91 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  38.5 
 
 		 226 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  40.85 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  38.79 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  40.65 
 
 		 730 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  37.56 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  39.07 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  36.62 
 
 		 223 aa  150  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  38.25 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  41.67 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.99 
 
 		 743 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  37.5 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  36.45 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  34.42 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  117  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  31.31 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  28.44 
 
 		 226 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  27.1 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>