57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3812 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3812  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.271205  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3654  hypothetical protein  86.7 
 
 
189 aa  312  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  72.04 
 
 
192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  68.78 
 
 
188 aa  266  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  69.89 
 
 
188 aa  257  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0508  protein of unknown function DUF1239  61.17 
 
 
191 aa  240  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03015  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4521  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.424898  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3571  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  240  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3495  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0501  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  240  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3687  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  240  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3392  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  240  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  61.38 
 
 
191 aa  239  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03064  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000319366  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3578  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3614  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.150228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3509  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3507  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3676  hypothetical protein  61.17 
 
 
191 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.228825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  60.75 
 
 
187 aa  235  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  60.75 
 
 
187 aa  235  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  40.59 
 
 
206 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  28.8 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  31.52 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  29.19 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  31.69 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  29.19 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  29.17 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  31.82 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  28.33 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  26.26 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  24.29 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  25.7 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  25.7 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  25.7 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  25.7 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  25.84 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  27.94 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  24.58 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  25.7 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  24.72 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  24.58 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  24.58 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  23.33 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  24.72 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2889  hypothetical protein  26.85 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.903337  normal  0.225255 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  24.04 
 
 
195 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  24.04 
 
 
195 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  24.68 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  26.81 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  25.5 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  24.49 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  22.87 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  27.37 
 
 
190 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  27.07 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  24.73 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>