23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1837 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  76.95 
 
 		 287 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  57.99 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  52.94 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  34.95 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  34.41 
 
 		 189 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  33.87 
 
 		 189 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  33.87 
 
 		 187 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  36.31 
 
 		 187 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  31.82 
 
 		 198 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3513  bacteriophage CI repressor  31.28 
 
 		 195 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0780259  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  31.09 
 
 		 208 aa  89.7  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  25.43 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3505  repressor protein  32.17 
 
 		 137 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.07388e-18 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  25.12 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  36.26 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  23.81 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  28.28 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 129 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  31.08 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2950  repressor protein  24.1 
 
 		 95 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132196  hitchhiker  1.92904e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  34.15 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3705  CI repressor  36.23 
 
 		 126 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>