32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2328 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  48.56 
 
 
247 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  51.03 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  46.88 
 
 
277 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  44.71 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  35.54 
 
 
249 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  36.67 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  39.5 
 
 
249 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  40.89 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  39.83 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  35.17 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  36.8 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  38.49 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  39.83 
 
 
255 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  39.5 
 
 
247 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  37.61 
 
 
247 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  36.67 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  34.78 
 
 
247 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  36.28 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  36.65 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  35.75 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  39.56 
 
 
243 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  31.56 
 
 
237 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  36.13 
 
 
236 aa  92  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  34.55 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  33.91 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  32.16 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  34.22 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  35.42 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  30.2 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  30.77 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>