18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1057 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1057  cytochrome c class III  100 
 
 
134 aa  282  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.795502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  31.39 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  32.33 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  31.58 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0215  cytochrome c, class III  34.29 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  32.43 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0649  cytochrome c class III  35.48 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2499  cytochrome c class III  42.65 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0504  cytochrome c, class III  30 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3182  cytochrome c3  33.33 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.943841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0720  cytochrome c, class III  28.03 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  33.7 
 
 
581 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0558  cytochrome c class III  26.72 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3754  cytochrome c3, putative  30 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  29.75 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1731  cytochrome c class III  31.82 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  29.36 
 
 
224 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4047  cytochrome c, class III  24.14 
 
 
149 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000990135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>