More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1009 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 263 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  59.7 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  61.02 
 
 		 270 aa  299  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  62.66 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  54.33 
 
 		 267 aa  274  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  53.94 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  53.15 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  54.72 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  54.12 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  55.29 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  48.24 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  45.53 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  48.03 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3703  hypothetical protein  45.49 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  41.34 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  41.34 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  41.73 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  48.65 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  41.83 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  39.77 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  46.43 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  46.43 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  44.98 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  41.63 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  41.63 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  44.98 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  41 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  44.98 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  42.8 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  44.98 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  41.34 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  41.8 
 
 		 260 aa  184  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  41.8 
 
 		 260 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  41.8 
 
 		 260 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  42.52 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  40.62 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  44.54 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  40.62 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  40.23 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  41.41 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  41.11 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  40.62 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  40.62 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  46.46 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  40.23 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  40.23 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  39.06 
 
 		 261 aa  181  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  40.23 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  45.37 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  40.53 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  40.53 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  45.54 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  40.53 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  40.53 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  40.49 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  45.05 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  46.26 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  42.98 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  44.34 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  45.5 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  39.25 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  42.98 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  40.94 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  45.37 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  43.04 
 
 		 265 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  45.81 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  39.29 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  40.71 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  41.8 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  40.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  40.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  40.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  41.41 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  43.98 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  40.23 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  41.02 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  39.84 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  39.84 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  39.84 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  43.17 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  39.84 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  39.84 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  43.04 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  42.36 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  44.64 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  41.59 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  41.02 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  42.73 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  43.98 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  42.29 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  40.55 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  43.98 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>