38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2493 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  33.12 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  30.37 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  32.84 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  30.89 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  31.15 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  29.77 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  28.46 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  26.51 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1996  hypothetical protein  29.45 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  27.92 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  30.89 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  29.22 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  25.42 
 
 		 112 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  27.35 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  26.22 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1476  hypothetical protein  34.57 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.332272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  28.32 
 
 		 116 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  26.96 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0952  Domain of unknown function DUF1791  34.57 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.306347  normal  0.0406177 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  30.16 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  29.17 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  25.64 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  24.36 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  26.62 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  27.5 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  30.4 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  30.91 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  25.48 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  28.07 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  29.32 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  33.9 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  27.64 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1310  hypothetical protein  25.41 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  29.17 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  28.4 
 
 		 115 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>