34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4532 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4532  transport protein  100 
 
 		 354 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  58.33 
 
 		 344 aa  329  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  31.84 
 
 		 361 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  32.78 
 
 		 361 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  35.67 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  32.74 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  32.45 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  31.34 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  38.78 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  29.32 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  31 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  29.43 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  27.65 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  30.52 
 
 		 538 aa  63.2  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  33.8 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  32.86 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  31.43 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  26.52 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  27.32 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  35.29 
 
 		 402 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  32.31 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  28.38 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  25.38 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  28.61 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  24.76 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  27.94 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  26.68 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  27.32 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.05 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  26.8 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  20.69 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  25.31 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  26.73 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>