35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3694 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2603  hypothetical protein  56.25 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105588  normal  0.589316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2008  hypothetical protein  54.08 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1812  protein of unknown function DUF1311  54.08 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  44.05 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  34.02 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  30.93 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  28.69 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  29.1 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  31.97 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  25.58 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  31.48 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  25.58 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  31.62 
 
 		 134 aa  42  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2137  hypothetical protein  31.65 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24990  hypothetical protein  31.65 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  29.17 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  29.91 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  28.92 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  36.26 
 
 		 462 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  31.19 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  32.56 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  32.56 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  32.56 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  32.56 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  33.98 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>