More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2561 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2561  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  81.63 
 
 		 317 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  81.29 
 
 		 317 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  46.71 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1774  rhodanese domain-containing protein  44.91 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.608218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2738  rhodanese-related sulfurtransferase  42.95 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.848314  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1396  rhodanese domain-containing protein  41.95 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  36.59 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3785  rhodanese-like protein  36.12 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5900  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  0.469982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0500  rhodanese domain-containing protein  32.28 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.346469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  31.27 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.55 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  25.95 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  30.77 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  27.14 
 
 		 276 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0560  Rhodanese domain protein  27.92 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000058867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.47 
 
 		 276 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  28 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  29.96 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  29.96 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  28.94 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0792  rhodanese domain-containing protein  30.05 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  25.95 
 
 		 285 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  26.69 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  28.84 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  26.69 
 
 		 321 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  23.55 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  26.58 
 
 		 284 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.74 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  28.57 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.92 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.17 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  27.31 
 
 		 267 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  27.04 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  27.46 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  28.17 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  28.93 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  27.86 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.18 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.09 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  26.52 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  26.92 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  26.79 
 
 		 284 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.35 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  29.28 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  25.45 
 
 		 284 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  27.74 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  25.75 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  27.88 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  26.71 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  27.9 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  24.91 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  25.18 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  27.9 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.4 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  28.18 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  26.72 
 
 		 647 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  27.9 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  28.73 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.56 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  25.77 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  24.91 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  26.1 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  24.29 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  30.45 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  27.37 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  30.4 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  27.9 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  26.16 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  25.67 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  27.37 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  24.37 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  25.45 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  27.88 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  26.86 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  28.96 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.02 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0198  Rhodanese domain protein  26.27 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  27.27 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.57 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  27.37 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  25.84 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  28.93 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  25.88 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  25.51 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  25.78 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.17 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  28.63 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  29.23 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  25.36 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  24.7 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  29.01 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>