299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_R0024 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  95.06 
 
 		 81 bp  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  92.65 
 
 		 84 bp  95.6  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  95.83 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  88 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0058  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>