41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3502 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  72.77 
 
 
440 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  71.17 
 
 
441 aa  634    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 
439 aa  898    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  79.36 
 
 
438 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  97.49 
 
 
439 aa  881    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  71.17 
 
 
439 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  70.09 
 
 
441 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  59.31 
 
 
449 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  56.52 
 
 
445 aa  494  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  56.52 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  55.5 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  43.04 
 
 
480 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  39.51 
 
 
450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  39.69 
 
 
450 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  39.12 
 
 
457 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  41.23 
 
 
448 aa  308  9e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  42.31 
 
 
437 aa  299  6e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  37.89 
 
 
448 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  36.11 
 
 
450 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  36.22 
 
 
449 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  36.22 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  34.96 
 
 
449 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  34.08 
 
 
488 aa  247  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  34.9 
 
 
491 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  33.41 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  35.16 
 
 
457 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  33.9 
 
 
502 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  31.59 
 
 
411 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  28.14 
 
 
262 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  26.64 
 
 
422 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  25.45 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  25.23 
 
 
424 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  26.16 
 
 
427 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  22.79 
 
 
425 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  22.73 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.76 
 
 
572 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  23.25 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  23.25 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  24.52 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  23.85 
 
 
409 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  25.35 
 
 
399 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>