37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2603 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  100 
 
 
76 aa  153  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  98.68 
 
 
76 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  38.89 
 
 
80 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  38.03 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  43.42 
 
 
76 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  44 
 
 
73 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  44 
 
 
73 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  43.42 
 
 
76 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  37.5 
 
 
74 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  35.14 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  37.31 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  43.28 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  35.14 
 
 
76 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  36 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  29.33 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  39.29 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  35.14 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  32.88 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  27.4 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  35.14 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  30.26 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  44.68 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  32.43 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  31.82 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  34.33 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  31.08 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  31.58 
 
 
74 aa  43.5  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  40 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  29.87 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  42.42 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  35.59 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  35.59 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  30.99 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  35.62 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  32.79 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  32.79 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1099  YcfA family protein  39.68 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.718032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>