45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0725 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 315 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.59 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.27 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  55.19 
 
 		 318 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.57 
 
 		 317 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.44 
 
 		 324 aa  342  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.1 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  47.12 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  39.5 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.14 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  38.68 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  40.63 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  40 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  35.99 
 
 		 327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.31 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  35.99 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.62 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.39 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.61 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  22.74 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  27.44 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  21.89 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000109546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.77 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0749  putative NADH-flavin reductase  26.53 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.38 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3787  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.71 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.44 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.47 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.66 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.65 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9273  putative oxidoreductase  30.4 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1956  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.31 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000864089  hitchhiker  0.00126231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.91 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.51 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2107  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.87 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.51 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2505  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.87 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000697027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>