More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3133 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
269 aa  560  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  73.33 
 
 
270 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1575  alpha/beta hydrolase fold protein  62.22 
 
 
271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  57.62 
 
 
269 aa  340  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  43.51 
 
 
269 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  43.13 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  42.75 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  43.13 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  42.75 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  42.75 
 
 
269 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  42.75 
 
 
269 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  41.22 
 
 
269 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  41.22 
 
 
269 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
301 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
297 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 
297 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  35.98 
 
 
292 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
273 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
273 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  32.85 
 
 
272 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
235 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  32.97 
 
 
272 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
272 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
272 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  32.97 
 
 
272 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
272 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 
281 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
290 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
272 aa  148  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
340 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 
274 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
278 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  34.25 
 
 
273 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 
279 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
273 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
279 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  32 
 
 
273 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
269 aa  141  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
276 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
334 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 
286 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
274 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
273 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
273 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
273 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
273 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
274 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  35.55 
 
 
281 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  31.52 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.54 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
273 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  29.64 
 
 
276 aa  132  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  32.83 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  34.07 
 
 
278 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  34.07 
 
 
278 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  34.07 
 
 
278 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  34.07 
 
 
278 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  31.23 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  31.23 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  34.07 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  31.58 
 
 
278 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  31.47 
 
 
274 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
324 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
286 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
276 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  29.3 
 
 
277 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
278 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  32.03 
 
 
280 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  33.6 
 
 
273 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
276 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  33.6 
 
 
273 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
278 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
276 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
276 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
290 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
278 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  31.34 
 
 
326 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  31.34 
 
 
326 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>