234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3084 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  100 
 
 		 378 aa  778    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  59.2 
 
 		 384 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  58.56 
 
 		 390 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  58.09 
 
 		 377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  58.67 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  57.33 
 
 		 380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  55.85 
 
 		 384 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  55.41 
 
 		 379 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  55.56 
 
 		 379 aa  438  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  54.52 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  55.59 
 
 		 379 aa  428  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  54.52 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  54.79 
 
 		 379 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  54.52 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  54.26 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  54.52 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  54.52 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  54.52 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  54.52 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  54.26 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  54.52 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  53.97 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  52.19 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  52.19 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  49.07 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  48.53 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  48.39 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  48.39 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  46.7 
 
 		 398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  48.02 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  45.43 
 
 		 384 aa  342  5.999999999999999e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  47.49 
 
 		 384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  44.41 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  44.99 
 
 		 371 aa  332  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  45.19 
 
 		 375 aa  323  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  44 
 
 		 376 aa  317  3e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  43.05 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  42.18 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  34.5 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  33.88 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  34.27 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  33.07 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  30.46 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  33.42 
 
 		 376 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  33.16 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  36.49 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1018  putative RNA methylase  35.01 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  32.35 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  30.65 
 
 		 387 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  32.24 
 
 		 374 aa  196  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  30.6 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.73 
 
 		 713 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  30.6 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  29.73 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.7 
 
 		 749 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  29.73 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  29.51 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  30.28 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  29.6 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32 
 
 		 712 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  29.27 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  29.27 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  29.33 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  29.38 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.65 
 
 		 711 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  30.69 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  31.28 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.4 
 
 		 709 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.4 
 
 		 709 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.4 
 
 		 709 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.4 
 
 		 709 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.3 
 
 		 708 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00510  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  29.72 
 
 		 729 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.563195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.61 
 
 		 702 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.61 
 
 		 708 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.76 
 
 		 707 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2378  putative RNA methylase  28.65 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74505  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.34 
 
 		 702 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.69 
 
 		 711 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  31.34 
 
 		 702 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  31.34 
 
 		 702 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.76 
 
 		 707 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  31.34 
 
 		 702 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.34 
 
 		 702 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.34 
 
 		 702 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.34 
 
 		 702 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.5 
 
 		 711 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.34 
 
 		 702 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.68 
 
 		 709 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.96 
 
 		 706 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.97 
 
 		 711 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  28.95 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 468 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  29.1 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.19 
 
 		 718 aa  169  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  31.94 
 
 		 484 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.42 
 
 		 711 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  28.34 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.1 
 
 		 713 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1764  putative RNA methylase  28.86 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.37357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>