30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3042 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  550  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000144784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  44.69 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  43.38 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  42.18 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312193  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  39.93 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0198  hypothetical protein  38.75 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0181  hypothetical protein  38.75 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000193703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  37 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  34.56 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  35.58 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  37.14 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  31.85 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  34.44 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  29.08 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  36.29 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  27.8 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  28.87 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.73 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  27.51 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  25.6 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  33.82 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  34.83 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  28.26 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  28.48 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  33.88 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  28.99 
 
 		 209 aa  42.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  29.51 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>