26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08350 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  54.68 
 
 
265 aa  297  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  50 
 
 
273 aa  296  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  42.55 
 
 
273 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000144784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  41.22 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0198  hypothetical protein  40 
 
 
261 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0181  hypothetical protein  40.23 
 
 
261 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000193703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  36.86 
 
 
276 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  24.83 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  26.29 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  24.9 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  27.69 
 
 
220 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  27.71 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  26.57 
 
 
291 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  22.61 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  28.85 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  24.86 
 
 
264 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  30.91 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  30.38 
 
 
286 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  23.46 
 
 
226 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  26.49 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  30.19 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0082  Rhomboid family protein  31.43 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  25.79 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0064  rhomboid-like protein  29.5 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646008  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  27.52 
 
 
228 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>