29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0617 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  50 
 
 
265 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  49.63 
 
 
265 aa  268  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  43.22 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000144784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  42.01 
 
 
276 aa  203  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  38.98 
 
 
297 aa  201  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0198  hypothetical protein  35.34 
 
 
261 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0181  hypothetical protein  35.34 
 
 
261 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000193703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.36 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  32.71 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  28.93 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  32.41 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.85 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  32.2 
 
 
226 aa  52.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  29.66 
 
 
226 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  29.57 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  26.17 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  28.3 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0064  rhomboid-like protein  30 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  27.93 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0082  Rhomboid family protein  28.33 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  26.61 
 
 
293 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  31.86 
 
 
198 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  31.86 
 
 
198 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  29.82 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  29.46 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  28.5 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  37.5 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  35.45 
 
 
286 aa  42.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>