More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2744 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  52.53 
 
 
225 aa  222  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  48.89 
 
 
225 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  46.76 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
231 aa  198  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  46.85 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  47.72 
 
 
276 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 
236 aa  191  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 
225 aa  189  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  46.6 
 
 
225 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  48.24 
 
 
222 aa  167  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  43.13 
 
 
216 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  46.53 
 
 
226 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  43.24 
 
 
499 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 
498 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  43.05 
 
 
498 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  40.77 
 
 
242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  40.16 
 
 
264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  43.29 
 
 
507 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.82 
 
 
269 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  39.53 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 
261 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  35.22 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  33.03 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  39.65 
 
 
277 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1293  ATPase  40.09 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484642  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  38.06 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  38.86 
 
 
275 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
266 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02560  ABC transporter  36.89 
 
 
249 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
278 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  39.15 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.06 
 
 
261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
281 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  32.89 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  31.9 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  32.89 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  31.9 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1683  ABC transporter related protein  33.62 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.44 
 
 
272 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.55 
 
 
273 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38 
 
 
265 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.89 
 
 
286 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.55 
 
 
292 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
277 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.15 
 
 
309 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  32.31 
 
 
262 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  37.26 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  32.31 
 
 
262 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.12 
 
 
277 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  32.31 
 
 
262 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.75 
 
 
264 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  31.22 
 
 
261 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.92 
 
 
262 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  35.34 
 
 
259 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.05 
 
 
272 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  35.06 
 
 
257 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  33.46 
 
 
278 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.93 
 
 
263 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  36.93 
 
 
263 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  38.56 
 
 
266 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  32.79 
 
 
262 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  38.26 
 
 
265 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
264 aa  104  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.54 
 
 
262 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  35.68 
 
 
277 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  36.4 
 
 
274 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  28.34 
 
 
246 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.06 
 
 
274 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  31.54 
 
 
262 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 
278 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  35.53 
 
 
279 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.31 
 
 
262 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  36.4 
 
 
281 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  34.5 
 
 
254 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.48 
 
 
253 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0377  ABC transporter related  33.48 
 
 
261 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.308685  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
307 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
307 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
307 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
307 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
307 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
307 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
307 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.06 
 
 
284 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.1 
 
 
260 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 
281 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 
300 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
282 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  36.75 
 
 
247 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  36.48 
 
 
266 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>