More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6713 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6713  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
321 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.19 
 
 
325 aa  414  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2841  alcohol dehydrogenase  62.54 
 
 
323 aa  408  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1358  NADPH:quinone reductase or related Zn-dependent oxidoreductase  44.69 
 
 
315 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0269743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44 
 
 
320 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759564  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4136  alcohol dehydrogenase  40.19 
 
 
321 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137043  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  38.84 
 
 
319 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3662  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2350  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
319 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2677  putative zinc-binding dehydrogenase  37.76 
 
 
319 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1771  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.08 
 
 
321 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278592  normal  0.0140179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4126  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 
320 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4240  alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 
320 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3277  alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 
320 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.124844 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0108  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.3 
 
 
346 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.45338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0946  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.3 
 
 
372 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1132  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.3 
 
 
321 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1031  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.3 
 
 
372 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1506  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.3 
 
 
666 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.68895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2272  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.3 
 
 
321 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1661  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.45 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.47 
 
 
318 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2294  alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
319 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306144  hitchhiker  0.00260878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3912  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
322 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3046  alcohol dehydrogenase  39.86 
 
 
281 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.28 
 
 
314 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0050  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.7 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3085  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
320 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  28.14 
 
 
328 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.36 
 
 
328 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.14 
 
 
328 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.36 
 
 
328 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  28.14 
 
 
328 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  28.14 
 
 
328 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  27.84 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  27.67 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1915  alcohol dehydrogenase  31 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.15 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.38 
 
 
328 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.36 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.32 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  30.27 
 
 
325 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.24 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  28.34 
 
 
336 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  28.24 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.39 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.91 
 
 
327 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.58 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.43 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
319 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.1 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.26 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.45 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.07 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.6 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  28.52 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5154  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266092  normal  0.177147 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.73 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  27.15 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.1 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1673  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  27.24 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.73 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.22 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.67 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  26.12 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  25.08 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.98 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  26.64 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.64 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  25.65 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  23.95 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  26.46 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.61 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.34 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
334 aa  79  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  26.91 
 
 
332 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  24.92 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.24 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.5 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1869  putative oxidoreductase  28.24 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  25.17 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  27.16 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0411  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.44 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.48 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21890  putative oxidoreductase  25.15 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278447 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08518  Putative uncharacterized proteinTdiC ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AT62]  25.44 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554432  normal  0.01647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3808  alcohol dehydrogenase  24.48 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.73 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.8 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.96 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>