37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5766 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  314  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  51.54 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  53.17 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  58.56 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  41.9 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  33.57 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  30.95 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  32.5 
 
 		 350 aa  75.1  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  30 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  32 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  30.63 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  29.92 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  35.29 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  29.46 
 
 		 270 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  29.63 
 
 		 274 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  27.03 
 
 		 357 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  23.42 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  26.58 
 
 		 326 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  29.29 
 
 		 590 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.8 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.49 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.24 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  27.84 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  28.28 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  27.84 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  27.84 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.73 
 
 		 342 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  27.84 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  26.8 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.3 
 
 		 374 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  26.8 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  26.8 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  25.23 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  25.2 
 
 		 705 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2173  Redoxin domain protein  27.62 
 
 		 336 aa  40.8  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.46 
 
 		 789 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>