More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5294 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5294  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1417  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
262 aa  281  8.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600645  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1215  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1117  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575081  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1383  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0458  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.240886  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0182  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167024  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1469  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
256 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00354465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2612  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
258 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.429757  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1669  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
266 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2883  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
258 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.678974  normal  0.736618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1929a  enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 
209 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.991387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
260 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2596  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
268 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
260 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
260 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
258 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.17 
 
 
262 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
259 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.13 
 
 
256 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
256 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 
260 aa  99  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.07 
 
 
262 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.46 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  29.59 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
268 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.5 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  35.95 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  31.65 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
267 aa  92.4  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2806  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.73 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
262 aa  92  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00100  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.85 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.9 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.086276  normal  0.305741 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05273  3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A lyase/3-methylglutaconyl-coenzyme A hydratase (EC 4.1.3.4)(EC 4.2.1.18) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6S014]  28.88 
 
 
599 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.347874  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 
263 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.97 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2816  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 
278 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2831  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.9 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.53 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  37.13 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3949  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.10876  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.26 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.97 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  38.41 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4192  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.22 
 
 
285 aa  82  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0750  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  31.93 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0287  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.56 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  31.12 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  30.06 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.5 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  28.77 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.63 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  29.48 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4689  enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  0.713982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>