13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4024 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1685    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  39.8 
 
 		 812 aa  621  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  31.89 
 
 		 820 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  25.94 
 
 		 832 aa  273  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  20.18 
 
 		 791 aa  143  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  22.29 
 
 		 806 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  18.48 
 
 		 802 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1075 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  19.94 
 
 		 892 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  18.57 
 
 		 892 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  24.69 
 
 		 1031 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  19.46 
 
 		 884 aa  44.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  28.21 
 
 		 911 aa  44.3  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>