67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2698 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2698  carbonic anhydrase  100 
 
 
212 aa  447  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1090  carbonic anhydrase  74.62 
 
 
198 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  30.73 
 
 
165 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  35.14 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  25.79 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  29.32 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  32.8 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  26.6 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  29.69 
 
 
198 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  31.25 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  25.57 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  23.21 
 
 
180 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  29.69 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  26.14 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  30 
 
 
164 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  28.8 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  27.27 
 
 
163 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  29.69 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  26.44 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  30.23 
 
 
197 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  23.81 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  29.37 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  26.36 
 
 
163 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  26.36 
 
 
163 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  26.36 
 
 
163 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  23.62 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  23.64 
 
 
164 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  22.02 
 
 
190 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  25.45 
 
 
163 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  25.6 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  25.6 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25.6 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.6 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25.6 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.6 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  25.23 
 
 
150 aa  49.3  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.6 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  25.6 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  25.45 
 
 
163 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  21.43 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  24.11 
 
 
175 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  25 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
109 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  24.76 
 
 
134 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  26.55 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  23.33 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  24.19 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  21.82 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  27 
 
 
150 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  27.61 
 
 
182 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  22.94 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  25.31 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  24.55 
 
 
163 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  22.73 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  24.17 
 
 
180 aa  45.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  21.88 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  26.79 
 
 
150 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  25.89 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  25.45 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  23.85 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  24.32 
 
 
150 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  23.78 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  25.23 
 
 
163 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  23.42 
 
 
163 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  24.07 
 
 
192 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  23.93 
 
 
217 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.148403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>